El programa de Magíster en Teología está dirigido a estudiantes que buscan profundizar su formación académica y ministerial desde una perspectiva participativa, reflexiva, crítica y dialógica, con el propósito de servir mejor a las comunidades de fe o en la docencia en el campo de la teología. El currículo ha sido diseñado considerando diversas áreas del campo de la reflexión teológica y pastoral. El enfoque está puesto en la problematización de los temas a través de preguntas y sustentadas en un conjunto de enfoques bibliográficos que permitan adquirir una visión amplia de las posibles respuestas que a estos problemas se pudieran dar.